alframework.tools package

Submodules

• alframework.tools.molecules_class module
  • MoleculesObject
    • MoleculesObject.append_atoms()
    • MoleculesObject.check_convergence()
    • MoleculesObject.check_stored_results()
    • MoleculesObject.get_atoms()
    • MoleculesObject.get_metadata()
    • MoleculesObject.get_moleculeid()
    • MoleculesObject.get_results()
    • MoleculesObject.get_system_signature()
    • MoleculesObject.set_converged_flag()
    • MoleculesObject.store_results()
    • MoleculesObject.update_atoms()
    • MoleculesObject.update_metadata()
  • compare_chemical_composition()
• alframework.tools.plotting module
  • analysis_plot()
• alframework.tools.pyanitools module
  • PY_VERSION
  • anidataloader
    • anidataloader.cleanup()
    • anidataloader.get_data()
    • anidataloader.get_group_list()
    • anidataloader.group_size()
    • anidataloader.h5py_dataset_iterator()
    • anidataloader.iter_group()
    • anidataloader.size()
  • datapacker
    • datapacker.cleanup()
    • datapacker.store_data()
• alframework.tools.tools module
  • annealing_schedule()
  • build_ANI_info()
  • build_input_dict()
  • compute_empirical_formula()
  • find_empty_directory()
  • load_config_file()
  • load_module_from_config()
  • load_module_from_string()
  • parsl_task_queue
    • parsl_task_queue.add_task()
    • parsl_task_queue.get_completed_number()
    • parsl_task_queue.get_exec_done_number()
    • parsl_task_queue.get_failed_number()
    • parsl_task_queue.get_number()
    • parsl_task_queue.get_queued_number()
    • parsl_task_queue.get_running_number()
    • parsl_task_queue.get_task_results()
    • parsl_task_queue.get_task_status()
    • parsl_task_queue.print_status()
  • random_rotation_matrix()
  • store_current_data()
  • system_checker()